Hallo,
ich würde zunächst via ssh als root User versuchen den apache neu zustarten (/etc/init.d/apache2 restart). Sollte der Webzugriff dann weiterhin nicht möglich sein würde ich die Anlage mal rebooten. Sollte es dann immernoch nicht möglich sein auf die Commander Weboberfläche zuzugreifen, könnte man mittels (/usr/bin/nice -n 19 /usr/bin/ionice -c3 /sbin/backup.pl) den Full-Backup-Job ausführen, welcher das /BACKUP/appliance.iso erstellt. Von diesem könnte man eine neue VM aufsetzen.